R・G・B

《Ｄ・ペネトレイト》で 生成 された デバイス を 破壊 した リーダー は エンドフェイズ に 破壊 した数だけ BP を チャージ できる効果があります。
上記の場合、このカードの【２】の効果で効果処理時に BP を チャージ し、エンドフェイズ に《Ｄ・ペネトレイト》の効果で更に BP を チャージ できます。

※《Ｄ・ペネトレイト》で 生成 した２枚を合わせてこのカードの 影響範囲 に３枚の ユニット・デバイス を配置し、その状態でこのカードを 使用 し 破壊 した場合、最大５ チャージ されます。

はい、カウントされます。
例えば《エネルギー・タンク》や《究極時限爆弾》を含めて３種類の デバイス があった場合でもこのカードを 使用 できます。

現時点では以下の処理になります。
《Ｒ・Ｇ・Ｂ》の最新のテキストでは、BP を チャージ する 永続 効果は「効果処理時に」という記載をしています。
そのため『効果が処理された場合、効果処理時に適用される 永続 効果』という解釈になります。

上記の場合、《Ｒ・Ｇ・Ｂ》は効果が不発になっているため「効果処理時に自分の BP を チャージ」という 永続 効果の適用条件を満たしていないため、チャージ されない形になります。